Trim the docs to their own jobs

The methodology keeps only the method that reaches the paper's
conclusions; the research plan becomes the proposal minus its
externalized method chapter; the standing rules move to a
Chinese conventions.md; the project-structure inventory, a
hand-kept mirror of the tree itself, is deleted.

Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>

docs/conventions.md

@@ -31,11 +31,11 @@ agent 不得見之）。凡於本專案工作的主會話，動手管線、
   不符預期時，修訂定義檔並重複該循環；絕不手改結果。
 - 一步的每次執行皆自我完備歸檔於 `run-llm` 命令列上
   明示指定的目的目錄下（慣例為
-  `data/runs/<步驟>/run<N>/`）：定義檔快照、原始輸出與
+  `runs/<步驟>/run<N>/`）：定義檔快照、原始輸出與
   `meta.json`（model ID、參數、時間戳、batch ID）。
   一步的 N 次執行即 N 次各自的 `run-llm` 呼叫。覆蓋
   既有執行歸檔須明示旗標；被取代的執行留在 git 歷史。
-  確定性步驟歸檔於 `data/runs/<步驟>/`，不分 `run<N>` 層。
+  確定性步驟歸檔於 `runs/<步驟>/`，不分 `run<N>` 層。
 - 每次 `run-llm` 執行的 token 用量與費用記入
   `docs/run-costs.md`，與執行歸檔同一 commit。
 - 腳本自環境變數 `ANTHROPIC_API_KEY` 讀取 API key
@@ -46,22 +46,19 @@ agent 不得見之）。凡於本專案工作的主會話，動手管線、
 - `data/source/` 存手放後不動的原始檔；
   `data/captures/` 只由 fetch 命令與私人匯入腳本
   寫入；`data/manual/` 只由研究者親手寫入；
-  `data/derived/` 只由 `build-db` 子命令寫入；
-  `data/runs/` 存 LLM 執行的原始歸檔，只由執行程序
-  寫入；`data/results/` 存論文引用的定案表，只由
-  計票程序寫入。
+  `data/derived/` 只由 `build-db` 子命令寫入。
 - 歌詞全文有版權：一律置於 `data/captures/lyrics/`
   （gitignored），絕不 commit，亦絕不於 repo 任何處
   全文重現。
 
 ## 文件
 
-- `data/results/` 存計票後的定案表（論文所引）；
-  `data/runs/` 存原始稽核紀錄。論文只引 `data/results/`。
+- `results/` 存計票後的定案表（論文所引）；`runs/` 存
+  原始稽核紀錄。論文只引 `results/`。
 - **Commit 判準**：凡能由「committed 的輸入＋committed
   的程式」決定性再生者不 commit；凡不能者一律以文字
   格式 commit，格式跟著上文「資料規則」一節所定的
-  層次走。例外：`data/results/` 定案表與
+  層次走。例外：`results/` 定案表與
   `data/derived/` 人讀報表雖可再生仍 commit——理由是
   引用穩定性、審稿人零門檻、撰稿期數字變動可 diff；
   兩者皆與工作儲存同一動作產出，稽核鏈無中間空缺。

docs/output-validation.md

@@ -1,7 +1,7 @@
 # LLM 輸出的契約查核
 
 （2026-08-06 量測。對象為步驟 3 的三份執行歸檔
-`data/runs/3a-code/run1`–`run3`，共 883 首歌、44,149 筆標籤
+`runs/3a-code/run1`–`run3`，共 883 首歌、44,149 筆標籤
 指派、44,146 句引述。歌詞以模型實際看到的那一份為準，即
 `tools/instance/llm-input-code.jsonl`。）
 

docs/pilot-study.md

@@ -42,37 +42,52 @@ frame-aware 提示修正實驗,均由當時協作的 Claude Code 設計並
   研究問題。
 - **粒度選擇**:正式研究鎖定 thematic keywords 這一粒度,
   係繼承先導研究三種粒度的比較結果(keywords 過碎、themes
-  過早抽象)。
+  過早抽象),且於執行前鎖定以防事後擇優。
 - **`women-power` 一詞的來歷**:考據先導研究的 local agent
   存檔可知,其第一步指令含數十個範例 thematic keywords,
   其中即有 women-power——為當時協作的 Claude Code 依研究者
   長期表達的關注主動加入(研究者端播種,非明示指定);先導
   的標籤 `women-power-and-empowerment` 則是第三步強制合併
-  兩個關鍵字的管線人工產物(見 `decision-log.md` 2026-08-04
-  條)。
+  兩個關鍵字的管線人工產物。正式研究的探針因此指向被播種的
+  本詞 `women-power`,不用合併假影(見 `decision-log.md`
+  2026-08-04 條)。**附帶認清:先導第一步並非零語意提示,
+  此即正式研究「提示詞只定格式、不定語意」設計所矯正者。**
 - **簿記容量的教訓**:先導研究九百餘詞可以在單一回應內完成
-  分組;此法未沿用,詞彙表改由確定性程序產生(見
-  `decision-log.md` 2026-08-06 條)。
+  分組,正式研究的關鍵字規模已非此法所能及,詞彙表遂改由
+  確定性程序產生(見 `decision-log.md` 2026-08-06 條)。
 
 ## 四、被棄用的成果
 
 以下先導研究的產物未進入正式研究,論文亦未引用:
 
 - **genuine／peripheral／fake 三分類與「44% 假女性力量」**:
-  構念與分母均未經稽核回溯,未沿用。
-- **五種「假女性力量」類型(A–E)**:未沿用。
-- **pussy 一詞的修辭分類**:未沿用。
+  構念與分母皆與正式研究不同(正式研究為 145 首女性力量群
+  歌曲中 111 首有性別問題),兩者不可對讀。
+- **五種「假女性力量」類型(A–E)**:正式研究改由儀器分三個
+  發話脈絡各自歸納,得 43 條問題樣態(`results/patterns.csv`)。
+- **pussy 一詞的修辭分類**:正式研究範圍收斂至語彙的挪用與
+  污染,未納入。
 - **frame-aware(框架感知)提示修正法**:先導研究以框架判準
-  寫進提示以提高準確率;未沿用。
-- **三個獨立 LLM subagent＋人工仲裁的流程**:未沿用,原因見
-  `decision-log.md` 2026-07-30 條。
+  寫進提示以提高準確率;正式研究刻意不定義編碼,因為研究
+  對象正是 LLM 未受引導的自然編碼——把框架寫進提示,即無法
+  再以其輸出為批判對象。兩者的設計方向相反,故未沿用。
+- **三個獨立 LLM subagent＋人工仲裁的流程**:正式研究改以
+  Anthropic API 逐首獨立呼叫,原因見 `decision-log.md`
+  2026-07-30 條。
 
-## 五、它促成了可稽核的設計
+## 五、它如何促成正式研究的設計
 
 先導研究的根本限制不在結論對錯,而在**不可稽核**:沒有定義檔
 快照、沒有原始輸出歸檔、沒有參數紀錄,因此任何一個數字都無法
-回溯到產生它的那一次執行。正式研究的可稽核設計,正是針對這一點
-而立。
+回溯到產生它的那一次執行。正式研究的幾項設計正是針對這一點:
+
+- 所有 LLM 步驟改以 API script 執行,每次執行自我完備歸檔於
+  `runs/`;
+- 可逐項機械比對的判斷採三次執行＋多數決,並量測其穩定性
+  (見 `reliability.md`);
+- 定義檔只規定任務形狀,不給主題定義、判準或範例;
+- 每一筆編碼必附歌詞引述,供逐筆查核;
+- 輸出的契約遵從另行查核(見 `output-validation.md`)。
 
 換言之,正式研究對 LLM 輸出所採取的「不信任、須查核」立場,
 其第一個案例就是先導研究本身。