Reorganize data/ into source, captures, and manual layers

Co-Authored-By: Claude Fable 5 <noreply@anthropic.com>

docs/decision_log.md

@@ -119,3 +119,8 @@
   settings 的 `.env` 依 pydantic 慣例讀自 CWD（約定
   `tools/`），資料路徑原以 repo 根為 CWD，兩者衝突；顯式引數
   消滅隱性 CWD 契約，亦拒絕以父目錄推導兄弟檔案的隱性慣例。
+- **`data/` 依生命週期分三層**：`source/`（源頭，手放後不動）、
+  `captures/`（外部捕捉，只由 fetch 命令與私人匯入腳本寫入）、
+  `manual/`（人工著作，只由研究者手寫；之後的黃金標準編碼
+  亦居此）。理由：三種生命週期混住一層，目錄無法傳達「誰可以
+  寫哪裡」；顯式引數化後搬遷零程式改動。